股权设置是出资人根据其出资比例确定的，通常在公司设立时有一个各方洽谈出资份额的过程，在该过程中各位股东会考虑公司到底由谁享有控制权及各方的收益比例如何均衡等。可是在设置过程中难免会遇到各种风险，也不见得设置的股权结构合理，也有可能设置出畸形的股权结构。
股权设置畸形的情形
实践中股权设置畸形会因公司以及股东的出资额不同而有不同的表现形式，具体为：
1、平衡股权结构
所谓平衡股权结构，是指公司的大股东之间的股权比例相当接近，没有其他小股东或者其他小股东的股权比例极低的情况。在设立公司过程中，如果不是一方具有绝对的强势，往往能够对抗的各方会为了争夺将来公司的控制权，设置出双方均衡的股权比例。如果这种能够对抗的投资人超过两个，所形成的股权结构就较为科学。但是如果这种能够对抗的投资人只有两个，则将形成平衡股权结构。
2、股权过分集中
事实上有很多公司有一个主要出资人，为了符合过去的公司法有关规定才找了其他小股东共同成立公司。这种情况下，很容易出现股权过分集中的结构，一个大股东拥有公司绝对多数股份。一股独大的情况下，董事会、监事会和股东会形同虚设，“内部人控制”问题严重，企业无法摆脱“一言堂”和家长式管理模式。但在公司进入到规模化、多元化经营以后，缺乏制衡机制，决策失误的可能性增加，企业承担的风险会随着公司实力的增强而同步增大。
另外，一股独大，导致企业的任何经营决策都必须通过大股东进行，其他小股东逐渐丧失参与公司经营管理的热情。一旦大股东出现状况，如大股东意外死亡或被刑事关押等，直接导致企业无法正常经营决策。等到一切明朗的时候，企业已经被推到了破产的边缘。
股权过分集中，不仅对公司小股东的利益保护不利，对公司的长期发展不利，而且对大股东本身也存在不利。一方面由于绝对控股，企业行为很容易与大股东个人行为混同，一些情况下，股东将承担更多的企业行为产生的不利后果；另一方面大股东因特殊情况暂时无法处理公司事务时，将产生小股东争夺控制权的不利局面，给企业造成的损害无法估量。
3、股权平均分散
股份分散为现代公司的基本特征，在这种情况下，有关股东如何实现对公司的控制权就显得尤为重要。一些公司的股权形成了多数股东平均持有低额股权，形成了“股份人人有份、股权相对平均”的畸形格局。
在众多平均的小股东构成的股权设置结构中，由于缺乏具有相对控制力的股东，各小股东从公司的利益索取权有限，参与管理热情不高，公司的实际经营管理通过职业经理人或管理层完成。公司管理环节缺失股东的有效监督，管理层道理危机问题较为严重。
另一种局面就是，大量的小股东在股东会中相互制约，要想通过决议必须通过复杂的投票和相互的争吵。公司大量的精力和能量消耗在股东之间的博弈活动中。
4、特殊的股权设置——夫妻股东
许多民营企业家在创业之初即为夫妻共同打天下，公司注册为夫妻两人所有；也有企业为了满足公司法规定的“公司股东必须为两人以上”的强制性要求，但又信不过别人，因此，将公司注册为夫妻两人所有，实质上由一人出资经营。
关于夫妻公司，我国公司法并未明确予以禁止，夫妻共同投资一家公司也并不具有任何法律上的瑕疵。实践中，夫妻公司往往与家庭并无实质分别，尤其是财产上混为一体，容易出现个别股东操纵公司、损害公司法人人格独立性，可能招致公司人格的丧失，失去“有限责任”的保护，将整个家庭与公司混同。2005年底修改《公司法》，确立了法人人格否定制度，夫妻公司经营管理活动不规范则存在法人人格被否定的法律风险。 因“夫妻公司”引发的法人资格否定的纠纷，主要体现在公司债权人要求偿还债务和夫妻离婚诉讼两种情况。从法人人格否定制度来讲，其目的在于保护债权人，只有在法人债权人提出诉讼请求时，法院才进行审查“夫妻公司”是否存在滥用法人人格的情况，决定是否否定法人人格。
公司如何设置股权
为了避免股权设置畸形的出现，在公司设立之初就应该合理的设置股权，具体为：
1、股权结构不要平均化
一些初创企业比较普遍的一个问题是股权结构平均化，几个哥们儿出来创业，大家一样吧。但是企业发展了一段时间之后，大家的贡献可能不一样，这个时候平均的股权就会带来一些问题。
在美国，几个创始人平分股权，公司也能做起来。但中国正相反，能够做起来的公司，更多还是一股独大。比较成功的模式是这样的，有一个大股东，是决策的中心；另外搭配几个占股10个点或8个点的小股东，有话语权，能跟老板唱唱反调。基于这样的一个模式，既保持有不同的意见，又有人拍板。
2、股权分配：利益结构要合理
创业期的公司一般都是有限责任公司。出资形式可以现金，实物，知识产权等，现金以外出资需评估或者大家协商一下，按价值设定股权比例。
也就是说，资金算一部分，工作能力算一部分，原来的背景、将来的贡献也算一部分，从这三个层面来划分股权比例。
股权分配的基本原则是，利益结构要合理，贡献要正相关。该拿大股的应该拿最大的股份，不该拿股份的人就不应该有股份。比如销售型公司，负责销售的创始人占股份多一些；产品型公司，负责研发的创始人就占得多一些。基本的原则就是股权只发给不可被替代的人，可被替代的人一般不需要股权。
创始人开始不在公司工作的，大家评估他的贡献，给他一定的股权，我们的意见是不要超过5%。这种创始人往往都是资源型的，比如可能掌握一些流量或者有一些客户关系，在创业初始特别重要，但是公司发展到一定的阶段，重要性就会降低。如果他拿的股份太多，反而会变成一个障碍。
如果觉得这样的人比较重要，可以在利益分配上，根据他提供的资源给一些补足。
只出资金的创始人其实就是一个民间的天使投资人，也可以给股份，但一个公司，出资的占什么样的比例，实际操作的占什么样的比例，是一个博弈的过程。一下子确定下来，其实也比较难。但是第一期小天使投资人，最好不要超过30%。因为如果太高，再做几次融资，主要的创始人很可能就不控股了。对创始人长远的激情会是一个伤害。
3、设立防冲突机制
对于股权分散的企业，一般都是建议,一是先做好股权集中，二是设立防冲突机制。现在通行的做法就是大家会签订一个共同发起公司的协议书，把各自的权利、义务包括发生纠纷的解决办法，全部白纸黑字约定清楚。比如某个股东因为一定的原因必须离开，那他的股权应该收回来。按什么价格、以什么方式收回。比如他在公司工作一年之内离开，要收回多少股份，工作一年之后或者两年要收回多少股份。这些都得在协议书里面写清楚。
一般公司团队出现内讧，基本上都不是发生在公司发展困难的时候，而是在公司情况好转的时候，比如拿到投资了，业务进展顺利了，大家都看到利益了。这个时候有些人会觉得自己的功劳更大，或者有些人会想要更大的自主权，这里面就往往会产生矛盾。
在刚开始的时候，很难确定股权怎么分配，建议团队里面比较核心的人物能够做一些代持，就是大家先有一些大体的分配，然后再根据这个来做一些调整，比如创业半年，可能大家都比较清楚状况了，根据大家事先的一些约定来做调整。
4、要适时发放期权
不同的公司不太一样，互联网类公司一开始设立，可能就会留有期权，但是有一些公司可能是会晚一些，时间点根据业务发展来定。
一般来讲，在业务已经可以看到比较明确的成长性的时候，发期权会是最好的一个时间点。如果发得比较早，虽然拿出了不少股份来做激励，但是其实员工没有感觉。
如果是在业务成长性比较好的时候给，能够让员工在接下去的时间切实感受到期权价值的增长。因为期权其实是一个双刃剑，如果价值不停地在增长，对员工的激励是很强的，但是如果给了期权之后，发现期权价值没增长，甚至是往下走的，就完全没有意义了。
股权畸形结构会带来很多负面影响，比如控股股东的“一股独大”情形，这将使得中小投资者丧失话语权，而且还会带来很多其他问题，使股市成了控股股东及其他原始股股东的提款机，这对小股东以及公司都是极为不利的。所以说公司一定要设置合理的股权结构，也可以设置优先股来解决控股股东持股比例过高的问题，总之尽可能的避免股权设置畸形出现。