在经济全球化的大背景下，在市场经济不断发展的今天，股权转让行为作为市场有效配置资源的重要手段正在变得越来越普遍，其在我国当前的产业结构调整和促进资源优化配置中也发挥着越来越重要的作用，然而随着经济的发展股权转让的形式和方法也日益复杂化，加上我国关于股权转让的税收规定却仅在规范性文件中体现，如何加强对股权交易行为的管控已经成为各级税务部门面临的新课题。
1、企业所得税
（1）企业在一般的股权（包括转让股票或股份）买卖中，应按《国家税务总局关于企业股权投资业务若干所得税问题的通知》（国税发（2000）118号，废止）有关规定执行。股权转让人应分享的被投资方累计未分配利润或累计盈余公积金应确认为股权转让所得，不得确认为股息性质的所得。
（2）企业进行清算或转让全资子公司以及持股95%以上的企业时，应按《国家税务总局关于印发<企业改组改制中若干所得税业务问题的暂行规定>的通知》（国税发（1998）97号，废止）的有关规定执行。投资方应分享的被投资方累计未分配利润和累计盈余公积应确认为投资方股息性质的所得。为避免对税后利润重复征税，影响企业改组活动，在计算投资方的股权转让所得时，允许从转让收入中减除上述股息性质的所得。
（3）按照《国家税务总局关于执行<企业会计制度>需要明确的有关所得税问题的通知》（国税发（2003）45号）第三条规定，企业已提取减值、跌价或坏帐准备的资产，如果有关准备在申报纳税时已调增应纳税所得，转让处置有关资产而冲销的相关准备应允许作相反的纳税调整。因此，企业清算或转让子公司（或独立核算的分公司）的全部股权时，被清算或被转让企业应按过去已冲销并调增应纳税所得的坏帐准备等各项资产减值准备的数额，相应调减应纳税所得，增加未分配利润，转让人（或投资方）按享有的权益份额确认为股息性质的所得。
（4）企业股权投资转让所得或损失是指企业因收回、转让或清算处置股权投资的收入减除股权投资成本后的余额。企业股权投资转让所得应并入企业的应纳税所得，依法缴纳企业所得税。
（5）企业因收回、转让或清算处置股权投资而发生的股权投资损失，可以在税前扣除，但每一纳税年度扣除的股权投资损失，不得超过当年实现的股权投资收益和投资转让所得，超过部分可无限期向以后纳税年度结转扣除。
2、契税
根据规定，在股权转让中，单位、个人承受企业股权，企业的土地、房屋权属不发生转移，不征契税；在增资扩股中，对以土地、房屋权属作价入股或作为出资投入企业的，征收契税。”
3、印花税
只要是在中国境内既具有法律效力，又受中国法律保护的凭证，无论其在境内或者境外书立，均应依照规定缴纳印花税。
股权转让存在两种情况：一是在上海、深圳证券交易所交易或托管的企业发生的股权转让，对转让行为应按证券（股票）交易印花税3‰的税率征收证券（股票）交易印花税。二是不在上海、深圳证券交易所交易或托管的企业发生的股权转让，对此转让应按1991年9月18日《国家税务总关于印花税若干具体问题的解释和规定的通知》（国税发1号）文件第十条规定执行，由立据双方依据协议价格（即所载金额）的万分之五的税率计征印花税。
4、增值税
自营改增以来，许多税种的征收方式发生了不小的变化，一些原本需要缴纳营业税的经济活动改为了缴纳增值税，一些就干脆免除了征税。在营改增之前，股权转让对于营业税的规定是这样的。根据《财政部、国家税务总局关于股权转让有关营业税问题的通知》（财税191号）规定：（1）以无形资产、不动产投资入股，与接受投资方利润分配，共同承担投资风险的行为，不征收营业税。（2）自2003年1月1日起，对股权转让不征收营业税。而关于增值税，《关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》（财税〔2016〕36号）延续了原有营业税规定，也未将股权转让行为纳入增值税的征税范围。因此，股权转让亦无需缴纳增值税。
营改增后，《财政部 国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》(财税[2016]36号)规定，金融商品转让，是指转让外汇、有价证券、非货物期货和其他金融商品所有权的业务活动。
《金融保险业营业税申报管理办法》(国税发[2002]9号)第七条规定，金融商品转让外汇、有价证券或非货物期货的所有权行为。包括：股权转让、债券转让、外汇转让、其他金融商品转让。
依据上述规定，金融商品转让不包括股权转让，因此，转让非上市公司的股权，不征收增值税。
企业股权转让的所得税处理
根据国家税务总局《关于企业股权投资业务若干所得税问题的通知》（国税发118号，废止）的规定：
企业股权投资转让所得或损失是指企业因收回、转让或清算处置股权投资的收入减除股权投资成本后的余额。企业股权投资转让所得应并入企业的应纳税所得，依法缴纳企业所得税。
被投资企业对投资方的分配支付额，如果超过被投资企业的累计未分配利润和累计盈余公积金而低于投资方的投资成本的，视为投资回收，应冲减投资成本；超过投资成本的部分，视为投资方企业的股权转让所得，应并入企业的应纳税所得，依法缴纳企业所得税。
伴随着我国资本市场的发展与企业改制的深化，股权转让日渐普遍。股权转让是公司法的概念，但却与税收有着紧密的联系。为加强对股权转让税收管理，国家税务总局出台了相关的税收政策，对加强管理起到一定的作用。通过上述税收的介绍，这是关于企业间的股权转让的税收问题，主要涉及企业所得税、印花税、契税和增值税。若是股东个人之见的股权转让，则不涉及这么多税项，主要是关于个人所得税的征收。