一、工程款支付应注意的问题
1、在使用将工程款直接打到承包方指定的账户时，在每次打款时应该留有票据，在留有票据的情况下，一但出现问题可以根据票据取证。
2、在使用将工程款直接打给个人的请况时，应注意与这个指定的人履行委托授权手续，此手续应咨询有关人员，需要履行规范的手续。许多问题的发生是因为在签署委托授权手续时不够规范，让一些心存不轨的委托人钻了法律的空子，从而让他们逍遥法外。在这里需要向指定的人员开据规范的收款凭据，并且收款日期、收款金额与实际中的要相符。
3、使用第三方方式支付时，需要签订规范的书面协议，每次打款需要有完备的凭据，还需要在行政机关或者司法机关的组织协调下进行，以免被第三方恶意诈骗而造成无法估量的损失。
4、一些房地产企业在不能够支付资金的情况下会选择使用房屋抵债，只是在使用此方式时，并不是单纯的交换模式，是需要开发商与购房人签订一些合同并开具一些有效的发票的，只是由于价格上的不能妥协和房屋在开盘后的不定因素容易造成纠纷。
二、工程款支付流程
1、施工单位每月25日前提交《工程款支付申请表》，并提供完整的工程清单资料送监理审核，同时报送工程费付款审核表。
如施工单位25日之后申请付款，造成延期付款责任由申请单位自负；
2、监理在接到上述申请资料后二天内完成审核工作，对已完成形象进度进行审核，提交《工程款支付证书》，报送工程部审核；
3、工程部收到上述资料后，工程部经理应在一天内完成审核工作，并在《工程款支付审批单》提出审核意见签字，附加当月25日可以完整说明工程形象的照片，然后提交总工程师审核；
4、总工程师收到上述资料后，一天内完成审核工作，然后提交工程咨询单位审核，此审核工作为五天；
5、工程咨询单位审核完成后，提交《工程款支付审核书》及审核资料至总工程师；
6、总工程师审核《工程款支付审核书》及审核资料，并在《工程款支付审批单》上提出审核意见签字，以电子邮件方式提交董事会成员《关于XX·XXX进度付款情况报告》、《工程款支付审批单》，此审核工作为一天；
7、董事会一天内完成审核工作，相关领导在《工程款支付审批单》上明确意见并签字，此过程为内部流转程序；
8、上述审核完毕后，由总工程师将《工程款支付审批单》提交财务主管，由财务主管通知施工单位本次付款核定金额。施工单位必须在每月10日前将完税发票交财务，财务收到发票后在三个工作日内付款。