出口加工区是实行全封闭、卡口管理的海关特殊监管区。出口加工区的基本政策是按照“境内关外”的思路进行设计的。其主要特点如下：
一、出口加工区的硬件建设规范、统一，设施先进，为高效、快捷运行和有效管理提供了良好条件
出口加工区实行统一规划，分期开发。已验收的区块，基础设施完备，为入区投资者提供了良好的条件。出口加工区的监管设施技术先进，为既要高效快捷运行又能实现有效监管提供了充分的保障。
比如在货物进、出通道卡口安装集装箱和车牌识别系统、电子地磅及电子闸门放行系统，大大提高了卡口的通关效率。在出口加工区海关建立计算机局域网系统，可实行计算机联网管理和无纸化报关，既简化了手续，又保证了严密监管。
二、出口加工区的管理和运行，有较健全的法规，可实现规范管理和依法行政
国务院批准实施的《中华人民共和国海关对出口加工区监管的暂行办法》，对出口加工区的性质、功能、实行的主要政策、出口加工区与境外、区外及区内货物监管等都作了明确规定。此后，海关总署、外经贸部、国家税务总局、国家外汇管理局、国家质检总局等有关部门都按照国务院批准的《办法》，相继制订了有关管理办法或实施细则，总共有10多个配套办法，为出口加工区的规范管理和正常运作提供了法律保障。为进一步加强出口加工区的法制建设，国务院法制办已将《出口加工区条例》列入立法计划，有关部门正在进行调研起草。
三、出口加工区实行一系列税收、外汇管理等优惠政策，有利于入区企业降低成本，更好地发展
中国加入世贸组织后，按世贸组织规则办事，只有出口加工区和保税区在特定区域中实行进口税收优惠政策。这些政策的要点是：
1、区内生产性的基础设施建设项目所需的机器、设备和建设生产厂房、仓储设施所需的基建物资，予以免税；
2、区内企业生产所需的机器、设备、模具及其维修用零配件，予以免税；
3、区内企业为加工出口产品所需的原材料、零配件、元器件、包装物料及消耗性材料，予以保税；
4、区内企业和行政管理机构自用合理数量的办公用品，予以免税；
5、国家对区内加工产品不征收增值税；
6、从区外进入加工区的货物视同出口，区外企业可凭有关单证向税务机关申请办理出口退税；
7、区内企业收付汇手续较区外企业简便。区内机构的所有的外汇收入均可以存入外汇帐户，所有外汇支出均可以从外汇账户支付。出口收汇和进口付汇均不需办理核销手续。这些政策使得区内生产的出口产品不含有任何税赋。
四、出口加工区的货物通关最快捷，对企业的管理手续最简便，可以大大提高企业在国际市场上的竞争能力
海关对出口加工区内企业的加工贸易管理模式进行了重大改革。货物进出出口加工区，企业只需在加工区海关“一次申报”，海关“一次审单、一次查验”即可放行。有的出口加工区卡口，在货物进出上，已实现了视同于口岸的延伸（如上海松江、大连等出口加工区）。区内企业免设保证金台账，取消登记手册，通过计算机联网，实现了无纸报关。区内企业从事加工贸易的审批和管理手续极为简便，为提高企业在国际市场上的竞争能力创造了非常有利的条件。
五、出口加工区有特定功能，进区企业是有条件的
出口加工区是一个有特殊功能的区域，不可能包罗万象。入区的企业必须具备两个条件，即：企业类型必须是生产加工型的（或为其服务的仓储企业、运输企业）；企业生产的产品必须是面向国际市场、以出口为主的。而且主要有以下几类：
1、产品在国际市场竞争激烈、接到订单后要求在很短期间内交货的企业；
2、原材料、零部件品种繁多，单耗核定复杂的企业；
3、出口产品的龙头企业，也就是我们说的下游企业，产品总装在加工区，配套在区外的企业。
六、企业加工产品可部分内销
生产企业面临激烈的市场竞争，无论内资或外资，投资者都希望充分利用国际、国内两个市场。如国际市场发生变化，产品无法全部外销时，希望能够有一部分内销。
在出口加工区监管办法中，没有不允许内销的规定。由出口加工区运往区外的货物即为进口，要按规定办理进口报关手续，按进口状态征税，如属许可证管理商品还应向海关出具有效证件。这样的规定是合理的，因为出口加工区享受“境内关外”的政策，区内所有生产要素（厂房、设备、材料等）都是不含税的，从进出口税收角度讲，与在海关关境之外生产的产品是一样的，内销时理所当然要象进口一样征税和管理。对企业没有内外销比例的限制，这是符合世贸组织规则的。
七、出口加工区是实现加工贸易规范管理、提高企业竞争力、促进发展的有效形式
出口加工区是国家为了促进加工贸易健康发展、规范加工贸易管理、适应加入世贸组织和面临经济全球化新形势而设立的。改革开放以来，我国加工贸易取得了巨大发展，从1996年起，一直占据我国外贸进出口总值的半壁江山，其中出口占到全国出口总值的55%左右。加工贸易在我国的经济发展、扩大出口、吸收外资、促进产业结构升级、解决就业等方面起着十分重要的作用。
但由于加工贸易范围广泛，几乎涉及到海关税则所列的所有大类商品，再加上各地经济发展和产业结构的差异，加工贸易的规模大小、产业结构、具体形式各不相同，因此海关的管理难度也是很大的。海关监管有一条基本原则是既要做到严密有效监管，又要最大限度简化手续，达到高效快捷。出口加工区就是能够实现这二者结合的一种很好的管理模式。在管理的严密性、规范性以及最大限度抑制走私行为发生方面，是任何其他管理方式都无法相比的，同时又是手续最简便、通关最快捷、管理最宽松的监管方式。在经济全球化和国际市场剧烈竞争的形势下，出口加工区可以成为促进加工贸易健康发展、提高企业在国际市场上竞争能力的非常有效的措施和手段。