根据《林木种子生产经营许可证管理办法》（以下简称《办法》）的规定，从事主要林木商品种子生产的单位和个人，应当向县级以上人民政府林业行政主管部门或者其所属的林木种苗管理机构申请林木种子生产许可证。
一、提交材料
申请林木种子生产许可证的单位和个人，应当提交以下材料：
（一）注有生产者基本情况、生产品种、技术人员、设施设备情况等内容的林木种子生产许可证申请表；
（二）生产用地使用证明和资金证明材料、采种林分证明及生产地点检疫证明；
（三）林木种子检验、生产技术人员资格证明；
（四）林木种子生产、加工、检验、贮藏设施和仪器设备的所有权或者使用权证明。
申请领取具有植物新品种权的林木种子生产许可证的，应当提供品种权人的书面同意证明或者国家林业局品种权转让公告、强制许可决定。
申请领取林木良种的林木种子生产许可证的，应当提供国家林业局林木品种审定委员会或者省、自治区、直辖市林木品种审定委员会颁发的林木良种证书复印件。
二、审核发放
（一）条件
符合下列条件的，林业行政主管部门应当核发林木种子生产许可证：
1、具有繁殖种子的隔离和培育条件；
2、无检疫性病虫害；
3、具有按照有关标准、规定建立或者确定的种子园、母树林、采穗圃或者其他采种林及苗圃地；
4、具有必要的生产、检验设施和资金；
5、具有经县级以上人民政府林业行政主管部门培训合格取得资格证书的林木种子生产、加工、检验、贮藏、保管技术人员（其中大田育苗面积不足50亩的，应当具有技术员或者育苗熟练人员；大田育苗面积50亩以上100亩以下的，应当具有相关专业中等专业以上学历、初级以上技术职称或者经县级以上人民政府林业行政主管部门培训的技术人员；采用容器育苗、组织培养、温室、大棚等先进技术设备进行育苗生产或者大田育苗面积超过100亩的，应当具有相关专业大专以上学历、中级以上技术职称或者经省级以上人民政府林业行政主管部门培训的技术人员）。
生产籽粒、果实等有性繁殖材料的，除具备前款规定的条件外，还应当具备以下条件：
1、具有晒场、种子加工和烘干设备、贮藏设施，包括种子库、种子风选和精选机等；
2、具有恒温培养箱、光照培养箱、干燥箱、扦样器、天平、电冰箱等必要的种子检验仪器设备。
（二）程序
1、主要林木良种的林木种子生产许可证，由种子生产者所在地县级人民政府林业行政主管部门审核，省、自治区、直辖市人民政府林业行政主管部门核发；其他林木种子（包括苗木）的生产许可证由种子生产所在地县级以上地方人民政府林业行政主管部门核发。
2、县级以上人民政府林业行政主管部门应当在收到申请或者审核材料之日起15个工作日内，对提供的有关材料及生产用地、生产机械、经营场所、仓储设施、检验设施、仪器设备等进行审核，对符合以上规定条件的，签署审核意见或者核发林木种子生产许可证；不符合条件的，应当书面通知申请者或审核的机关，并说明理由、退还有关材料。