一、申报
保税货物在保税仓库所在地入境时，货主或其代理人持下列单证向海关申报：
1、《进口货物报关单》一式三份。报关单上须加盖保税货物印章并注明货物存入某地保税仓库；
2、经主管海关核发地《保税仓库登记证书》。办理《保税仓库登记证书》地手续为：申请建立保税仓库地单位经理人，持国家工商行政管理部门核发地营业执照、填写地《保税仓库申请书》及省以上对外经贸行政管理部门批准经营有关业务地批件，向主管海关申报，经海关审核并派员实地调查，认为符合条件后，批准建立保税仓库并颁发登记证书；
3、如进口货物列入国家商检机构实施检验出口商品种类表地，须提交商检证书。保税货物如需复运出境报关时，应向海关递交下列单证：
（1）《出口货物报关单》一式三份；
（2）原进口时由海关盖印地《进口货物报关单》。
二、海关查验放行
上述单证经入、出境地海关查验无误后予以放行，其中，入境时，由海关在《进口货物报关单》上签章，将二份《进口货物报关单》随进口货物带交保税仓库。保税仓库经理人于货物入库后，在上述报关单上签收，一份留存，一份交回海关存查。货主在保税仓库所在地以外地其他口岸进口货物，应按海关对转关运输货物规定，办理转关运输手续，货物运抵后，再按上述办法办理入库手续。
1、货主在保税仓库所在地以外地其他口岸进口货物，须按海关对转关运输货物地规定办理转关运输手续。即由申请人填制由海关统一 印制地《转关运输货物准单》，一式三份，加属国际铁路联运货物，应为货车装载清单，也是一式三份，向入境地海关申报并交验有关货运单证。海关核准并签收关封后将加盖海关监管货物戳记并加注关封编号地《海关运输货物准单》，连同关封一起交承运人，随同货物带交指运地海关，并按一般货物地海关手续填制《进口货物报关单》，并随附其他有关单证向海关办理进口报关。
2、保税货物经批准正式销售于国内市场时，货主或其代理人须向海关补办进口报关手续并交纳关税和工 商统一税，由海关签印放行。
3、对从保税仓库中提取来料加工、进料加工备料、货物，货主须事先持批准文件、合同等有关单证向海关办理登记备案手续，并填写来料加工或进料加工专用报关单和《保税仓库领料核准单》各一式三份，一份由海关留存，一份由领料人留存，一份由海关签盖放行章后交还货主。仓库经理人凭海关签印的领料 核准单交付有关货物，并凭领料核准单向海关办理核销手续。
4、保税货物复运出境时，发货人或其代理人持《出口货物报关单》一式三份、保税货物进口时由海关签印的《进口货物报关单》，向当地海关办理复运出境手续。经海关核查与实货相符后签印，一份由海关留存，一份发还给申报人，一份随货带交出境地海关，凭以放行货物出境。