国有土地上房屋征收范围内未经登记建筑怎么处理？

2005年某市人民政府决定对路南地块旧城改建项目实施征收，先生的有照房屋以及一处未经登记房屋坐落于征收范围内。2005年因先生与市人民政府未能达成房屋补偿协议，市人民政府对先生作出了房屋征收补偿决定和国有土地上房屋征收范围内未经登记建筑认定决定书，认为先生的一处未经登记的建筑属严重影响城乡规划的违法建筑，不予补偿。
房屋征收部门应当对房屋征收范围内房屋的权属、区位、用途、建筑面积等情况组织调查登记，在没有履行调查核实的情况下，市人民政府就作出了国有土地上房屋征收范围内未经登记建筑认定决定书，况且此认定决定书并不能证明先生的一处未登记的房屋是违反建筑，因此对先生的无照房屋作出不予补偿决定，是没有法律依据的。